今天这篇文章以识别用于mRNA疫苗开发的有效抗原为目的，进行了大量生信分析。
文章三月份发表在MolecularCancer（IF:15.）。纯生信发15分，其实里面的分析并不复杂，而是敢上了研究热点。
文章首先识别了胰腺癌中与不良预后和抗原呈递细胞浸润相关的过表达且突变的基因作为潜在的肿瘤抗原。鉴于mRNA疫苗仅对部分患者有益，作者紧接着识别了胰腺癌免疫亚型用以鉴定具有更高疫苗反应的患者。
文章三月份发表在MolecularCancer（IF:15.）。IdentificationoftumorantigensandimmunesubtypesofpancreaticadenocarcinomaformRNAvaccinedevelopment胰腺癌肿瘤抗原和免疫亚型的鉴定及其mRNA疫苗的研制一、摘要：尽管mRNA疫苗对多种癌症有效，但其对胰腺癌(PAAD)的疗效仍不明确。越来越多的证据表明，免疫分型可以反映肿瘤的综合免疫状态及其免疫微环境，这与肿瘤的治疗反应和疫苗接种潜力密切相关。本研究的目的是鉴定PAAD中潜在的mRNA疫苗发育抗原，进一步区分PAAD的免疫亚型，构建一个适合于选择接种疫苗的免疫景观。二、材料方法：从ICGC中提取了个PAAD数据集的基因表达谱和临床信息，从TCGA中提取了个样本的RNA-Seq数据。用GEPIA计算差异表达水平和预后指标，用cbiportal程序比较遗传变异，用TIMER探讨基因与免疫浸润细胞的相关性。一致性聚类用于一致性矩阵构造和数据聚类，DAVID用于功能注释，基于图学习的降维用于描述免疫景观。
这些方法对一个生信基础人来说，是非常简单可以实现的。但知识是海洋，系统学习自个