导读:
近期,浙江大医院金洁教授团队通过对一例母细胞性浆细胞样树突细胞肿瘤(BPDCN)患者进行世和基因血液肿瘤DNA大PANELDNA测序(基因)和全转录组RNA-seq检测,首次在BPDCN中鉴定出了ARID1A突变,并提出了该疾病发生发展的演化模型。成果已于年11月发表在Haematologica(IF:7.)。
BPDCN是一种罕见的侵袭性血液系统疾病,起源于浆细胞样树突状细胞前体(pDC)。在年WHO造血系统肿瘤分类中,BPDCN归为急性髓系白血病和相关前体肿瘤。该病具有高度的侵袭性,常累及皮肤、淋巴结及骨髓,表现为白血病性播散,预后不良。临床常见细胞遗传学异常,据报道BPDCN患者中66%的患者呈现复杂核型异常,但目前尚未有统一的特异性疾病诊断标记。
文章为单病例报道,患者为男性,29岁,因背部皮肤出现红斑长达1年,且持续性贫血伴血小板减少而入院治疗。骨髓象检查发现异常单一形态的低分化原始细胞占90.5%,完善免疫表型分析及组织病理学检查后确诊为BPDCN。患者骨髓细胞核型分析结果显示为复杂核型45,X,–Y,der(1)(q24),–5,der(9)(q34),der(13)(q34),der(16)(q24),der(22)(q11),+mar。皮肤组织FISH检测结果为–Y,但5号染色体未显示缺失(详见图1)。随后对患者行一周期的Hyper-CVADA方案进行治疗,4周后骨髓完全缓解,背部皮肤红斑显著缩小。
图1:BPDCN患者的临床症状、细胞学检查、组织学检查以及细胞遗传学特征
为了揭示患者的分子遗传学变异特征,对患者的骨髓和皮肤组织样本进行世和基因血液肿瘤大PANELDNA检测+全转录组RNA-seq检测。检测结果如下表所示:
患者的骨髓和皮肤组织样本中均检测到ARID1A基因G64fsX99失活突变和Q67R突变(突变同步发生)。ARID1A是SWI/SNF复合体组成部分,该复合体起到抑制肿瘤的作用,有研究报道ARID1A基因功能缺陷可能导致有丝分裂过程中染色质分离障碍,从而导致染色体的不稳定,提示ARID1A基因突变可能是患者出现复杂核型的致病因素。另外发现,骨髓样本中单独检测到BCORL1基因,FLT3基因和NRAS基因突变;皮肤组织样本中单独检测到KRAS基因突变,结果提示侵犯骨髓和皮肤组织的细胞克隆存在差异,BCORL1突变和KRAS突变分别在骨髓和皮肤浸润细胞中发挥重要作用。
综合分析患者基因突变特征,揭示了一个可能的BPDCN发生发展的模型:首先获得的ARID1A失活突变引起染色体组不稳定,导致复杂的染色体异常,进而演变产生多种类型异常克隆。不同类型的异常克隆细胞在疾病的不同阶段具有不同的生长优势,具有BCORL1突变和5号染色体缺失异常的细胞易侵犯骨髓,而KRAS突变促进肿瘤细胞侵犯皮肤组织,最终发展形成BPDCN。
结语:
此病例为首例在BPDCN患者中鉴定出ARID1A突变,并提出了一种可能解释该BPDCN患者疾病发生发展的演化模型。BPDCN是一种罕见的侵袭性血液系统肿瘤,目前致病机制尚未阐明,缺乏特异性的诊断标记,二代测序技术因其具有高通量,高灵敏度,可同步检测多种基因及多种类型突变,在罕见血液系统肿瘤临床诊断及致病机制的探究中展现了其独特的优势。世和基因针对血液肿瘤的分子特点,在国内率先推出血液肿瘤DNA大PANEL+全mRNA临床检测,更全面的揭示患者的遗传学变异特性,辅助临床诊疗。同时获得更全面的疾病分子变异数据,助力于转化医学收获更多学术成果。世和基因始终秉持着严谨、专业的学术态度服务于广大临床专家,期待与更多的专家在临床和科研上建立合作关系。
金洁教授团队与世和基因的另一合作,详见链接:NGS血液肿瘤临床转化医学应用:完善老年AML患者预后评价模型
世和基因Geneseeq
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