编者按：膀胱癌是具有高发病率和高死亡率的恶性肿瘤，稳定上升的发病率和患病率使膀胱癌成为世界上最常见的泌尿生殖系统癌症之一。年，全球报告了,例新病例以及,例死亡病例。
膀胱癌可分为非肌肉浸润性膀胱癌(NMIBCs)和肌肉浸润性膀胱癌(MIBCs)，NMIBCs可发展成为MIBCs，MIBCs预后性较差且5年生存率较低。近来，来自四川大学的研究人员对膀胱癌肿瘤组织、癌旁组织以及正常组织中的基因表达进行分析，构建风险预测模型，用以提高预测两种类型膀胱癌患者5年生存率的准确性，帮助鉴定膀胱癌特定亚型。该研究于7月13日在线发表在《Nature》子刊《CellDeathDiscovery》上，标题为“Theprognosticvalueofsixsurvival-relatedgenesinbladdercancer”。
癌旁组织是实体瘤附近的组织，在肿瘤研究中通常作为对照品。但是，有研究表明癌旁组织与肿瘤组织及健康组织相比具有明显不同的特征，癌旁组织处于健康组织与肿瘤组织间独特的中间状态，当使用癌旁组织而非健康组织作为对照时，可能会掩盖其他信息。研究人员从UCSCXena以及NCBIGEO网站中下载膀胱组织的基因转录组数据进行差异表达基因（DEGs）的分析，具体包括GTEx数据库、TCGA数据库和GEO数据库。
实验共分析了例TCGA膀胱癌组织、19例TCGA癌旁组织、9例GTEx正常膀胱组织、36例GEO膀胱癌组织、29例GEO癌旁组织和5例GEO健康的膀胱。合并GTEx和TCGA的数据后，通过FPKM0筛选基因进行后续分析。通过差异表达基因分析发现，癌旁组织与正常组织中具有EMP1，TPM1，NRP2，FGFR1，CAVIN1和LATS2六个与生存相关的基因，这些基因在肿瘤组织中的表达显著下调（p?0.）。
生存相关基因在膀胱癌中的表达
有多项研究显示这6个与生存相关的基因在癌细胞扩散或侵袭过程中起到了积极的作用。研究人员根据TCGA中生存相关基因的表达，通过一致性聚类分析将膀胱癌患者分为cluster1和cluster2。主成分分析（PCA）表明，两组中的RNA表达是特异性的。对具有性别、年龄、分期、分级及生存状况等临床资料的例患者进行一致性聚类分析，除性别和年龄外，其他方面在两个cluster之间差别较大。对例患者进行预后因子M的分析，两组cluster间无显著差异。结果显示cluster1中这6个基因表达量更高，cluster2的总生存率显着高于cluster1，这与以往的研究结果相符。
两组患者的临床特征及生存相关基因的表达
研究人员采用LASSO回归分析和10折交叉验证在cluster1中构建了一个3-gene风险模型，可将患者分为高风险亚组和低风险亚组，两个亚组的总生存率存在显着差异。该风险模型包括基因EMP1、FGFR1和CAVIN1，其风险系数分别为0.、0.以及-0.。
影响膀胱癌预后的重要因素包括病理学分期和组织学分级，癌症预后可指导用药以及帮助设计合适的治疗方案。本研究中的6个与生存相关的基因可作为鉴定膀胱癌特定亚型的有用工具，该膀胱癌亚型的T、N、分期、等级和生存状态与其他膀胱癌的临床特征大不相同，患者的生存率与这些基因的表达呈负相关。在特定的亚型中，膀胱癌的预后可以通过由EMP1、FGFR1和CAVIN1基因组成的风险模型进行独立的评估。通过3-gene预后因素模型分类的高风险和低风险亚组，可能在细胞周期的负调控上具有不同的生物学过程，并且在外泌体中具有不同的细胞成分。这些可能是造成其不同预后因素的原因。
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参考文献
1.Cheng,S.,Jiang,Z.,Xiao,J.etal.Theprognosticvalueofsixsurvival-relatedgenesinbladdercancer.CellDeathDiscov.6,58().
2.AranD,CamardaR,OdegaardJ,etal.Comprehensiveanalysisofnormaladjacenttotumortranscriptomes.Nat.Commun.8,().
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文字/大地同年君
图片/网络
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