北京治疗白癜风到哪里去最好 http://pf.39.net/bdfyy/bjzkbdfyy/目前NGS在医学研究中应用越来越广,尤其是肿瘤方面,高通量测序逐渐成为了常规检测手段。为此我们筹备了“医学肿瘤生物信息学分析课程”。该课程是我们成熟的课程,以下我们分别从上期学员评价、课程内容、课程预期、课程说明四方面给大家介绍。往期学员评价[有限的调研,确实还没有差评]:课程内容安排:一、变异检测研究-SNP/INDELSomaticSNP/INDEL变异是肿瘤基因组学研究的基础。然而受限于肿瘤的异质性与其突变频率的特点,准确地检出这些变异仍然是需要足够的经验的。我们围绕BroadInstitute的SomaticSNVs+Indels的最佳实践及Strelka等软件展开学习,了解NGS比对、比对后处理、germline和somaticcalling的方法,并选择经典的数据集进行方法验证与讨论。二、变异检测研究-SV/CNVSV通常定义为至少50个核苷酸碱基(50bp)以上的基因组变异,大致包括删除、插入、复制、倒位和易位。SV不仅在表现形式和检测方法上更为复杂,而其影响各不相同,部分SV与特定的肿瘤类型息息相关,而另一部分可能在许多肿瘤中存在。SomaticSV的数量、范围和类型能提供对肿瘤生成机制的见解。SV也可能成为治疗目标,或用作预后标记物。这里我们将介绍和学习肿瘤结构变异检测的方法。三、肿瘤免疫治疗的生物信息分析肿瘤免疫治疗是目前最被寄予厚望的治疗方法,包括PD-1/PD-L、肿瘤疫苗等多种药物在临床研究中取得不错的结果。然而TMB的计算、新生抗原、免疫微环境的检测是其非常重要的环节。这里使用权威数据来开展讨论与实践,这些分析方法。四、肿瘤克隆性分析与肿瘤进化肿瘤具有强烈时空异质性,其细胞可以形成具有遗传差异的克隆群。为了细致了解肿瘤,我们需要对癌症的不同时期(时间)或对不同位置(空间)进行取样测序,检测突变,根据突变的位置、频率和拷贝数信息进行聚类和进化分析。这里我们介绍相关的工具与方法。五、高频突变基因与驱动基因检测高频突变基因与驱动基因的检测是研究肿瘤发生发展的一种重要的研究手段,相关的基因可能对于肿瘤有重要的驱动作用。这里我们来学习相关的软件与方法。六、肿瘤数据库学习与介绍介绍一下肿瘤分析中必要的一些数据库,TCGA、靶药数据库等,了解必要的肿瘤数据库资源。课程期望:那么这个课程学习后,我们觉得您应该有以下几方面的收获:掌握肿瘤变异calling与注释的基本方法,对于影响变异的特殊因素及其解决方案有一定的认识。掌握肿瘤免疫NGS相关分析,学会肿瘤免疫治疗的队列景观分析的研究方法。掌握肿瘤克隆与进化的研究方法与手段,解析肿瘤队列挖掘关键基因,结合数据库进行解读以发表高水平研究的套路与方法。适当拓展肿瘤NGS多组学研究的方法与手段。最终可实现初步具备开展肿瘤变异研究的相关课题或者搭建与开发肿瘤相关应用产品的能力。课程说明:由于本课程属于高阶内容,所以linux和python编程不会花很多时间讲解。但是我们会提供Linux和python方面的视频供大家预习,并且整个课程周期内随时接受答疑。同时该课程很成熟,所以我们会提供相应的视频教程供大家预习。同时我们会提供4个月的服务器账号供大家实际练习。直播课程结束后,支持1年的视频回放。报名费用:元/人。开课时间:12.19,每周六周日晚上19:00~21:00。课程持续9周时间,大概34小时左右。报名请加