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基础知识middot全外显子测 [复制链接]

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简介

外显子组测序原理是利用探针捕获技术,设计探针捕获基因组上的外显子区域,然后进行测序。通常来说,外显子占全基因组的1%~2%左右,即30~60M。测序深度一般在x以上,对于一些低频突变,有较好的检测效果。考虑到全外显子组测序可以轻易得达到x甚至x的测序深度,且成本较低,在肿瘤方面应用就非常广了。对于,全外显子组测序可以检测出来肿瘤组织中的一些低频体细胞突变Somaticmutations。一般做肿瘤全外显子组测序,在取样的时候需要注意,同一个病人要取肿瘤组织(可以有多个位点)和正常组织(一般是癌旁组织或外周血)。一般来说肿瘤样本测序深度可以是x以上,而正常组织30x即可。将肿瘤组织中发现的突变位点,过滤掉正常组织中发现的突变位点Germlinemutations,即可得到肿瘤组织中的体细胞突变Somaticmutations。在癌症异质性分析方面,多位点取样结合全外显子组测序是非常常见的实验设计思路。

外显子测序的视频教程:

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